东汉以后，州牧刺史权力有所扩大，一州之事，刺史可全权处理，刺史遂由监察官员而变为拥有实权的地方最高行政长官。
刺史有一定治所，常于每年八月出巡，岁末遣计史诣京师禀报刺史本人则无需亲入京师。刺史弹劾郡县守令则不必经过三公，而权归刺史，刺史往往派从事为耳目，竟至掌握二千石高官进退的大权。
东汉末年刺史改为州牧，在性质上已是地方行政长官，州、郡、县三级地方行政体制遂以形成。剌史仿将军府设置了官属僚佐，有长史、司马、东曹掾、诸校尉等。州牧郡守握有军、政、财大权，又有广大众民，实力自然雄厚，遂使中央徒有虚名，中央集权走向了地方割据。东汉地方行政区划如下表，郡(国)里还辖有县(侯国、邑、道)。
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州名
或都护府 |
治所
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所辖郡国
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备注 | |
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古名
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今地
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司州
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洛阳
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河南
洛阳东北 |
京兆尹、左冯翊、右扶风、弘农郡、河内郡
河南郡、河东郡 |
后汉都洛阳，不改三辅之号，唯中兴六年，尝改右扶称汉安郡。 |
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冀州
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鄗县
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河北
柏乡县北 |
魏 郡、钜鹿郡、渤海郡、常山国、中山国
安平国、河间国、清河国、赵 国 |
汉桓帝置博陵郡，汉末罢还安平。 |
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幽州
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蓟县
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北京市
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涿 郡、代 郡、上谷尹、渔阳郡、辽西郡
辽宁郡、玄菟郡、乐浪郡、广阳郡、右北平郡、辽东属国 |
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并州
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晋阳
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山西
太原西南 |
太原郡、上党郡、西河郡、五原郡、云中郡
定襄郡、雁门郡、朔方郡、上 郡 |
建安二十年正月，省云中、定襄、五原、朔方郡。 |
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凉州
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陇县
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甘肃清水北
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陇西郡、汉阳郡、武都郡、金城郡、安定郡
北地郡、武威郡、张掖郡、酒泉郡、敦煌郡张掖属国、居延属国 |
中平五年，分置南安郡。中平六年，省扶风都慰，置汉安郡。兴平元年，分安定、右扶风，置新平郡。建成安末，又立西海郡、西平郡。 |
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益州
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雒县
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四川广汉
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汉中郡、巴 郡、广汉郡、蜀 郡、犍为郡
牂牁郡、越巂郡、益州郡、永昌郡、广汉属国、犍为属国 |
汉灵帝复分蜀郡北部为汶山郡。 |
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交州
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龙编
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越南河内东
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南海郡、郁林郡、苍梧郡、交阯郡、合浦郡
九真郡、日南郡 |
建安八年，改曰交州，十六年徙治南海番禺县。 |
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荆州
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汉寿
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湖南常德市
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南阳郡、南 郡、江夏郡、零陵郡、武陵郡
桂阳郡、长沙郡 |
汉献帝建成安十三年，魏武尽得荆州长之地，分南郡以北立襄阳郡，又分南阳西界立南乡郡，分枝江以西立临江郡。建安时置西城、上庸、房陵三郡。 |
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扬州
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历阳
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安徽和县
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九江郡、丹阳郡、豫章郡、吴 郡、会稽郡
庐江郡 |
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| 合肥 | 安徽合肥 | |||
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豫州
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谯县
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安徽亳县
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颍川郡、汝南郡、梁 国、沛 国、陈 国
鲁 国、 |
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徐州
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郯县
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山东郯城县
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东海郡、广陵郡、琅邪国、彭城国、下邳国
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建安三年，分琅琊、东海、北海为城阳、利城、昌虑郡。建安初分琅姬、齐郡置东莞郡。 |
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青州
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临淄
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山东淄博市
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平原郡、东莱郡、济南国、乐安国、北海国
齐 国 |
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兖州
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昌邑
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山东
金乡西北 |
陈留郡、陈 郡、泰山郡、山阳郡、济阴郡
东平国、任城国、济北国 |
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西域都护府
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它乾
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新疆新和县
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